Давно разыскиваемый хакер, которого прозвали Кукловодом, начинает вмешиваться в политику, и тогда «9-й Отдел» Министерства Общественной безопасности, оперотряд полиции, оснащённый по последнему слову техники, получает приказ расследовать это дело и остановить Кукловода. В погоне за ним возникает вопрос: что делает человека человеком и кто такой Кукловод в этом мире, где граница между человеком и машиной почти незаметна?

Сюжет второго фильма «Невинность»

Прошло много лет после событий первого фильма. «9-й Отдел» по-прежнему выполняет свою работу. Похищена маленькая девочка и вскоре становится известно о случаях убийства владельцев роботами-гиноидами, самоуничтожающимися после этого. Но перед уничтожением дух одного из таких роботов попросил о помощи..

Сюжет третьего фильма «Закостенелое общество»
Во время расследования пути Бато и Мотоко пересекаются. Она предупреждает его не приближаться к обществу Solid State. Как выяснилось потом это общество было создано для использования ментальных ресурсов стариков (Kifu Aged) подключеных к здравоохранительной системе наблюдения, которая поддерживала их жизнь пока они не умрут естественной смертью. Также подключенные к системе могли заботится о сиротах или детях из неблагополучных семей, обретая смысл для жизни и завещая этим детям своё имущество после смерти. Однако, детей стали похищать чтобы сделать частью системы Solid State. Официальные лица ничего не подозревали об этом. За всем этим и стоял Кукловод, создавший инфраструктуру похищения детей и промывки мозгов им и их родителям.

Сюжет первого сезона сериала
Шесть лет назад неизвестным гениальным хакером был похищен президент крупной корпорации, производящей микромашины. Этот хакер взламывал все кибернетические устройства вокруг себя, поэтому никто не знает его лица, а вместо этого видят лишь эмблему «Смеющегося человека».

Эти события уже стали историей, но в Управлении МВД до сих пор работает опергруппа, расследующая дело «Смеющегося человека». И вот в руках одного из оперативников оказываются ценные улики…

Сюжет второго сезона сериала
«Девятый отдел» после расформирования создан заново. В Японии появляется группа «11», которая выступает за то, чтобы беженцам на острове Дэдзима в бухте Нагасаки были даны права. Их идеология основана на фиктивном эссе Патрика Сильвестра «11». Их лидер — Хидэо Кудзэ. «Девятый отдел» занимается обезвреживанием группы «11» и наведением порядка в Деджиме. Главный противник «Девятого отдела» — Года — создатель фиктивного эссе «11» и советник премьера-министра Японии по военной разведке. Дело осложняется личными проблемами Мотоко Кусанаги (главной героини): Кудзэ, ее противник, оказывается тем самым мальчиком, который когда-то значил для нее очень много.

Девятый отдел
Отдел МВД Японии действующей под именем Министерства Общественной Безопасности. Де факто организация для тактической разведки, устранения нежелательных личностей а также расследований не под силу полиции. Находится на верхних этажах небоскрёба города Ниихама включая 8 регулярных членов отдела. В связи с заданиями имеет:
Боевой вертолёт
Винтокрыл
Индивидуальный термо-оптический камуфляж
Операторы на ИИ
8 татиком
Новейшие разработки огнестрельного оружия

Футикомы и татикомы
Футикома (в манге) и татикома (в телесериале) — небольшой одноместный роботизированный шагающий танк, оснащённый искуственным интеллектом, используемый Девятым отделом. Футикомы и татикомы играют важную роль в сюжете манги и сериала, являясь неисчерпаемым источником для шуток, так и ставящих серьёзные философские вопросы. По своему значению порой даже оттеняют главных персонажей. В фильмах Мамору Осии подобные машины у Девятого отдела отсутствуют.

Татикома — двухметровый бронекомплекс, по виду напоминающий паукообразный танк на колёсах. Хорошо вооружены и оснащены, у них есть как крупнокалиберные пулемёты, так и пушка.

Из-за наличия огромной огневой мощи и выполнения заданий по обеспечению общественной безопасности, они не запрограммированы на безусловное выполнение приказов Девятого Отдела, так как не владеют понятиями работы и отдыха. Они самообучающиеся, хотя в Девятом Отделе их часто сбрасывают до начального состояния из-за слишком высокой скорости обучения.

Память татиком самосинхронизирующаяся, хотя среди них начинают появляться индивидуальности и любимчики. Стремятся понять смысл жизни и смерти, их образ мышления так похож на человеческий, что их внешний вид возможно был создан нечеловекоподобным, чтобы ими легко было жертвовать в бою. В своём развитии доходят до понятия самопожертвования и прототипа духов/призраков, удивляя этим даже Девятый Отдел.

Кукловод
Главный персонаж первого фильма. Киборг с искусственным призраком, работающим на правительство для выполнения дипломатических задач и провокаций. Его скрывают под псевдонимом «Проект 2501», разрешив достигать цели любыми методами. Прежде всего он хакер, взламывающий призраки людей по всему миру.

Кукловод интересуется Девятым Отделом, особенно Майором, и постоянно контактирует с ними. Воспользовавшись случаем, копирует свой призрак в киборга, который попадает в Девятый Отдел.

Его цель — эволюция призраков, подчиняющаяся теории Дарвина. Он предлагает Майору слиться с призраками, чтобы в результате из двух получить один призрак, являющийся не прямой копией, а совершенно новым объектом, по аналогии с генами живых существ.

Доспех Кукловода был уничтожен снайперами Министерства Иностранных Дел, фактически он умер в конце фильма.

Смеющийся человек
Главный персонаж первого сезона сериала. Высокий худой парень, в некотором смысле подражающий Холдену Колдфилду, персонажу романа Сэлинджера «Над пропастью во ржи», например желанием открыть всему свету правду о продажных людях или любовью к бейсбольной перчатке.

Юный гениальный хакер, получивший в своё распоряжение информацию о действии нового лекарства против склероза кибермозга (отмирание клеток мозга, контактирующих с имплантами). Способен взламывать множество призраков одновременно, кроме того предпочитает бумагу как источник информации, цитирует классиков.

Пытаясь помочь больным и остановить корпорации, предлагающие бесполезные и дорогие способы лечения, в прошлом похищает президента компании, производящей микромашины и пытается его принудить рассказать всем правду.

Не причастен к дальнейшим преступлениям, совершённым под его псевдонимом, предпочитая только взламывать призраки ответственных лиц и требовать от них добровольной огласки.

Спасает Майора от убийства и они делятся своей памятью, получая новый жизненный опыт, после которого Смеющийся Человек прекращает свою опасную для общества деятельность. Отказывается работать в Девятом Отделе, но Арамаки снимает с него все обвинения.

Загадочность его деяний для общественности и деятельность различных терроричтических организаций под его именем создали в обществе некий культ Смеющегося человека. Его значок был на футболках, кружках, кепках, в рекламе и т.д. Хотя массы так и не увидели его лица.